Assemblée Générale 2022
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Christophe Calvin ARISTOTE |
Philippe Futtersack EdF |
DATE & LIEU
23 mai 2022
13h30 - 16h00
EDF Lab Paris-Saclay
7, boulevard Gaspard Monge
91120 Palaiseau
Innovation numérique à EDF R&D et focus sur les jumeaux numériques
Etienne Decossin
EDF
Data harmonization in genomic medicine : GPU-accelerated bioinformatics methods for transcriptome analysis
Pauline Bazelle
Etienne Bardet
CEA
Innovation numérique à EDF R&D et focus sur les jumeaux numériques | Etienne Decossin
Responsable de programme Simulation avancée et Technologies numériques.
Data harmonization in genomic medicine : GPU-accelerated bioinformatics methods for transcriptome analysis | Pauline Bazelle et Etienne Bardet
Dans le cadre du projet Européen KATY, projet de médecine personnalisée ayant pour objectif de développer des modèles d’IA prédictifs de la réponse des patients porteurs de cancers du rein aux thérapies anti-tumorales, un des enjeux consiste à collecter et harmoniser le retraitement de données de profilages transcriptomiques de cohortes de tissus tumoraux. Le besoin de traitement de données volumineuses a entrainé la mise en place d’une collaboration avec NIVIDIA afin d’évaluer la performance et la pertinence des chaînes de traitements bioinformatiques portées sur GPU.
Ingénieure INSA Lyon, Pauline Bazelle est bio informaticienne au CEA (Dir. de la Recherche Fondamentale, Institut de Recherche Interdisciplinaires de Grenoble). Elle travaille sur le projet européen KATY de médecine personnalisée ayant pour objectif de développer des modèles d’IA prédictifs de la réponse des patients porteurs de cancers du rein aux thérapies anti-tumorales.
Étudiant en stage de Master 2 en bio-informatique. Le travail d’Etienne se concentre sur le Benchmarking des outils de traitement de données NGS compris dans la suite Clara Parabricks de NVIDIA. Le Benchmark vise à évaluer l’efficacité informatique des outils (temps d’exécution et utilisation mémoire) ainsi que la précision des résultats bio-informatiques générés.
